년도	내용
2001년 11월	제25회 한국고고학 전국대회 개최
2002년 8월	정징원 교수(고고학과) 제9대 박물관장 취임
2003년 10월	1종박물관 등록
2004년 3월	신경철 교수(고고학과) 제10대 박물관장 취임
2004년 4월	제13회 영남고고학회 창립20주년 기념 학술대회 개최
2006년 3월	밀양대학교박물관 통합
2006년 5월	일본 국립역사민속박물관과 연구교류협정 체결
2007년 1월	(사)한국대학박물관협회 사무국
2007년 11월	한일 삼국·고분시대의 연대관 국제학술회의
2008년 10월	한국대학박물관협회 제59회 추계학술발표회 및 제57회 정기총회